研究人员提取并研究了陶器内表面的残留物、陶胎中的微体化石以及陶器残片所在文化层中的微体化石。研究发现，陶器残留物中含有大量驯化稻的植硅体，还发现了稻米、薏苡、稗草、小麦族、橡子、百合等植物的淀粉粒，不少淀粉粒表明发酵过程的存在。此外，陶器上还有大量真菌微化石，其中有红曲霉和酵母菌。红曲霉至今仍被用于酿造传统红曲酒。

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上山遗址发现者、浙江省文物考古研究所研究员蒋乐平说，这证明在稻米驯化早期阶段，上山先民已会利用陶器特别是小口罐来酿造以红曲霉为主要糖化剂的稻米曲酒。

中科院地质与地球物理研究所博士生导师张健平研究员分析说，上山先民驯化了水稻，这为酿造发酵酒提供了稳定的原料，而全新世早期温暖湿润的气候为真菌生长提供了理想的环境条件。清晨用功，无论是成年人，亦或是老人与孩子，这是每一个人自幼就已养成的习惯。最后，几十名青壮年男子在村头集合，由族长石云峰带着来到旁边的雷击木前，对着老柳树认真祈祷。

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